Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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