Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms