Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFFO1Q0D2I5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms