Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms