Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms