Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SCN2BO60939 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms