Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HPS5Q9UPZ3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HPS5Q9UPZ3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms