Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms