Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RAB9BQ9NP90 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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