Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms