Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
COPS9Q8WXC6 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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