Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms