Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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COL5A1-AS1Q5SY13 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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