Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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ZNF239Q16600 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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ZNF239Q16600 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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