Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FRMPD4Q14CM0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms