Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms