Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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