Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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