Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC20Q12834 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms