Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CD300CQ08708 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms