Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms