Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX2Q04743 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms