Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HNMTP50135 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNMTP50135 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNMTP50135 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms