Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPREP23469 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPREP23469 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPREP23469 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPREP23469 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPREP23469 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPREP23469 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPREP23469 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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