Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPN2P04844 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPN2P04844 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPN2P04844 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms