Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DENRO43583 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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