Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
B4DXG7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
B4DXG7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DXG7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DXG7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DXG7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DXG7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DXG7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DXG7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DXG7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
B4DXG7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms