Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
YBX2Q9Y2T7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
YBX2Q9Y2T7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms