Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVW-1Q9UQF0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms