Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX7Q9UNH6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms