Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FANCFQ9NPI8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FANCFQ9NPI8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FANCFQ9NPI8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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