Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA3CQ99985 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA3CQ99985 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms