Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AC079465.1-201ENST00000416046 3361 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PRAC1Q96KF2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms