Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUPD1Q68J44 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms