Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6CQ53S08 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms