Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZFHX3Q15911 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms