Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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