Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABPB1Q06547 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms