Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFM1P61960 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.8 ms