Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GEMP55040 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GEMP55040 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GEMP55040 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms