Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHI3L1P36222 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHI3L1P36222 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHI3L1P36222 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms