Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAMP11215 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms