Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMPRSS11DO60235 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms