Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DENRO43583 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DENRO43583 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DENRO43583 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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