Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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