Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms