Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms