Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RABGGTAQ92696 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms