Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RFTN1Q14699 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RFTN1Q14699 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RFTN1Q14699 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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RFTN1Q14699 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RFTN1Q14699 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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RFTN1Q14699 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN1Q14699 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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