Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPIDRQ14159 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms